次磷酸的毒性屬于在高溫的時候會出劇毒，致死量用小白鼠最為實驗：

鼠經(jīng)口LD50：1200 mg/kg；小鼠經(jīng)口LC50：20 mg/kg；

大鼠腹腔LD：43 mg/kg；小鼠皮下LCLo：83600 ug/kg；

吸入毒性：大鼠：>1210 mg/m3/6H。

次磷酸如果揮發(fā)在環(huán)境之中，會對人體做成危害，且次磷酸揮發(fā)的時候?qū)χ車沫h(huán)境物質(zhì)以及生物都具有一定的毒性，不過次磷酸不溶于水，但是溶于乙醇，如果水中發(fā)現(xiàn)次磷酸需要格外的注意。

關(guān)于次磷酸的致癌問題，也是有的，在2017年下半年的時候被國際衛(wèi)生組織正式確定為三類致癌物質(zhì)（對人的致癌性尚無法分類，即可疑對人致癌）。